La frequenza di disinfezione di uno stetoscopio dipende dallo scenario di utilizzo e dall'ambiente:
Nei normali ambulatori, se lo stetoscopio viene utilizzato solo per pazienti generici e non vi è alcuna contaminazione evidente, si consiglia di disinfettarlo 1-2 volte a settimana.
Nei reparti come pediatria e pneumologia, che sono facilmente esposti ad agenti patogeni infettivi, o in aree speciali come i reparti di malattie infettive e le unità di terapia intensiva, la disinfezione deve essere effettuata dopo ogni utilizzo.
Se lo stetoscopio viene utilizzato da più pazienti diversi in un breve lasso di tempo, è meglio disinfettarlo dopo ogni utilizzo, anche se l'intervallo è breve.
